裏庭の土の細菌から新規抗生物質ラリオシジン…リボソームの新たな部位を攻撃

カナダのマクマスター大学（McMaster University）のデイビッド・ブラッドリー抗生物質発見センターの研究チームが、土壌細菌パエニバチルス（Paenibacillus sp. M2）が作る新規抗生物質ラリオシジン（lariocidin）を報告した。ラリオシジンは、リボソームで合成された後に修飾されるペプチド（RiPP）のうち、ラッソペプチド（lasso peptide）に属する。尾が輪を貫く投げ縄の形で構造がしっかり固定された分子で、リボソームを標的とするラッソペプチドは初めてである。

16S rRNA・tRNAと噛み合ってタンパク質合成を妨害

この菌株は、カナダ・ハミルトンのある民家の裏庭の土から見つかり、研究チームは成長の遅い微生物も取りこぼさないよう、約1年間培養した。構造・遺伝・生化学的な解析の結果、ラリオシジンはリボソーム小サブユニットの独特な部位に結合し、16SリボソームRNAやアミノアシルtRNAと相互作用して、転座（translocation）を妨げ、翻訳エラーを引き起こした。一般的な耐性機構の影響を受けず、自然に耐性が生じる頻度も低く、ヒト細胞への毒性は観察されなかった。アシネトバクター・バウマニ（Acinetobacter baumannii）に感染させたマウスモデルでも、強い効果を示した。

新しい化学骨格と作用機序を併せ持つことから、タンパク質合成阻害薬の開発の新たな道となる可能性がある。ただし、結果は細胞・動物レベルであり、大量生産法の確保と、ヒトを対象とした安全性評価が残っている。