土壌の粘液細菌、ゲノムを新たに154個解読　未探索の生合成遺伝子クラスター2,387個を確認

ドイツのヘルムホルツ・ザールランド医薬研究所（Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research Saarland、HIPS）とザールラント大学の研究チームが、数十年にわたり土壌から集めてきた粘液細菌（myxobacteria、粘液細菌門 Myxococcota）の分類体系を描き直し、天然物の生合成能力をゲノムレベルで整理した。Advanced Scienceの論文によると、新たなゲノム154個が加わり、科（family）は11から28に、属（genus）は32から90に増えた。プレスリリースでは、新しい菌株は118種と紹介された。

放線菌に劣らない生合成の多様性

抗生物質の伝統的な宝庫である放線菌（Actinomycetota）と同じ規模で比較すると、粘液細菌の生合成遺伝子クラスター（biosynthetic gene cluster）の多様性は引けを取らなかった。未同定の遺伝子クラスターのファミリーは2,387個に達し、その一部をゲノムマイニング（genome mining）で追跡して、ミクソルタミド（myxolutamid）、ミクソペンタシン（myxopentacin）など、新しい構造の化合物4種を確認した。プレスリリースは、抗真菌・抗ウイルス・抗菌活性、シデロフォア、トポイソメラーゼ阻害剤まで、5系統の新しい化合物クラス（ミクソクオーテリン、サンダクラビン、サンダラゾール、ソランジバクチン、ピキシディサイクリン）も紹介した。

ミクソルタミドAやソランギシン（sorangicin）誘導体のように、特定の系統の中で保存される化合物が多く、正確な分類がそのまま標的探索の地図になるというのが、研究チームの主張である。生合成遺伝子クラスターのウェブアトラス「ABC-Myxo」は無料で公開され、菌株はドイツのDSMZに保存される。

今回の結果はゲノム解析と構造の確認が中心で、化合物ごとの有効性・毒性の数値や動物実験は含まれていない。プレスリリースと抄録とで、菌株・化合物の数の表記が一部異なる。