Resecuenciados los genomas de 287 líneas de ginseng: identificadas dos glicosiltransferasas que marcan la diversidad de ginsenósidos

Un equipo del Instituto de Ciencias Animales y Vegetales Especiales de la Academia China de Ciencias Agrícolas (Chinese Academy of Agricultural Sciences) y otras instituciones resecuenció los genomas de 287 líneas de ginseng (Panax ginseng) y analizó a la vez el contenido de 169 ginsenósidos (ginsenoside), con lo que aporta la base genética del proceso de domesticación y de la diversidad de los principios activos. El artículo se publicó en línea en la revista PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences de EE. UU.).

Cinco grupos según la región y el color del fruto

El análisis de genética de poblaciones dividió las líneas de ginseng en cinco grupos según su distribución geográfica y el color del fruto. En el análisis de barridos selectivos (selective sweep) se observaron huellas de selección durante la domesticación no solo en genes relacionados con la adaptación al entorno y el crecimiento, sino también en genes de biosíntesis de triterpenos. También se comprobó que la composición de ginsenósidos varía entre los grupos.

En el estudio de asociación del genoma completo del metaboloma (mGWAS) se obtuvieron 12 676 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) asociados a los ginsenósidos. A partir de ellos, los investigadores hallaron dos glicosiltransferasas (glycosyltransferase), PgUXT y PgURT, y verificaron su función. Añaden xilosa y ramnosa, respectivamente, y influyen en la acumulación de más de la mitad de los ginsenósidos de la población. Como la distribución de los genotipos de ambas enzimas coincide con las diferencias de ginsenósidos entre grupos, los autores las proponen como candidatas a reguladoras de los puntos clave de bifurcación de la diversificación de los ginsenósidos. También presentaron un intento de predecir el contenido de ginsenósidos de cada individuo introduciendo las variantes genéticas identificadas en un modelo de aprendizaje automático.

Este estudio trata del análisis genómico y metabolómico y de la verificación de la función de las enzimas, y no aborda los efectos de los ginsenósidos en el organismo humano. El alcance geográfico de las líneas analizadas y su aplicabilidad al ginseng cultivado en Corea requieren una comprobación aparte en el texto original.