Secuenciados 154 genomas más de mixobacterias del suelo: identificados 2387 grupos de genes de biosíntesis sin explorar

Investigadores del Instituto Helmholtz de Investigación Farmacéutica del Sarre (Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research Saarland, HIPS, Alemania) y de la Universidad del Sarre han redibujado el sistema de clasificación de las mixobacterias (myxobacteria, filo Myxococcota), recogidas en el suelo durante décadas, y han ordenado su potencial de biosíntesis de productos naturales a nivel genómico. Según el artículo publicado en Advanced Science, se añadieron 154 genomas nuevos, con lo que las familias (family) pasaron de 11 a 28 y los géneros (genus), de 32 a 90. La nota de prensa presenta 118 cepas nuevas.

Una diversidad de biosíntesis comparable a la de los actinomicetos

Al compararlas a una escala equivalente a la de los actinomicetos (Actinomycetota), la fuente tradicional de antibióticos, la diversidad de grupos de genes de biosíntesis (biosynthetic gene cluster) de las mixobacterias no se queda atrás. Las familias de grupos de genes no caracterizados llegaron a 2387 y, al rastrear algunas mediante minería genómica (genome mining), se confirmaron cuatro compuestos de estructura nueva, entre ellos la mixolutamida (myxolutamid) y la mixopentacina (myxopentacin). La nota de prensa también presenta cinco clases de compuestos nuevos, con actividad antifúngica, antivírica y antibacteriana, sideróforos e inhibidores de la topoisomerasa (mixocuaterina, sandacrabina, sandarazol, sorangibactina y pixidiciclina).

Muchos compuestos, como la mixolutamida A o los derivados de la sorangicina (sorangicin), se conservan dentro de linajes concretos, por lo que, según los investigadores, una clasificación precisa se convierte en un mapa para la búsqueda dirigida de dianas. El atlas web de grupos de genes de biosíntesis, ABC-Myxo, se ha publicado de forma gratuita y las cepas se conservan en la DSMZ de Alemania.

Los resultados se centran en el análisis genómico y la confirmación de estructuras, y no incluyen cifras de eficacia o toxicidad de cada compuesto ni experimentos con animales. El número de cepas y de compuestos que figura en la nota de prensa y en el resumen del artículo difiere en parte.